Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NEUROD1Q13562 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEUROD1Q13562 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NEUROD1Q13562 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms