Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPK1Q13546 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPK1Q13546 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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