Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPM6BQ13491 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPM6BQ13491 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPM6BQ13491 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPM6BQ13491 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms