Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TCIRG1Q13488 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TCIRG1Q13488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TCIRG1Q13488 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
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