Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XRCC4Q13426 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XRCC4Q13426 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC4Q13426 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC4Q13426 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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