Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140Q13342 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140Q13342 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140Q13342 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140Q13342 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140Q13342 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP140Q13342 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP140Q13342 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140Q13342 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140Q13342 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140Q13342 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140Q13342 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140Q13342 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140Q13342 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140Q13342 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140Q13342 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140Q13342 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140Q13342 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140Q13342 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140Q13342 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140Q13342 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140Q13342 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140Q13342 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP140Q13342 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140Q13342 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140Q13342 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140Q13342 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140Q13342 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140Q13342 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140Q13342 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140Q13342 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140Q13342 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140Q13342 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP140Q13342 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP140Q13342 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP140Q13342 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SP140Q13342 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140Q13342 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140Q13342 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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