Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PSMD2-202ENST00000417952 721 ntTSL 323.36■■□□□ 1.334e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.284e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-206ENST00000554541 925 ntTSL 214.35□□□□□ -0.114e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 59.77□□□□□ -0.854e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 29.77□□□□□ -0.854e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.034e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.034e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.124e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.324e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SND1-205ENST00000467238 716 ntTSL 38.68□□□□□ -1.029e-11■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ZNF106-204ENST00000565500 4733 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.024e-6■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 227.23■■□□□ 1.951e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 48.87□□□□□ -0.991e-9■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 213.38□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 CNOT1-214ENST00000568917 1317 ntTSL 511.51□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-214ENST00000495305 1390 ntTSL 234.84■■■■□ 3.171e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.951e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 533.38■■■□□ 2.931e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)29.19■■■□□ 2.261e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)28.31■■■□□ 2.121e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-203ENST00000440571 1125 ntTSL 527.97■■■□□ 2.071e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.951e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.661e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 COG4-206ENST00000530160 554 ntTSL 425.07■■□□□ 1.61e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.581e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 224.89■■□□□ 1.581e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.561e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MRPL46-205ENST00000560703 670 ntTSL 322.88■■□□□ 1.251e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.111e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)21.62■■□□□ 1.051e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.041e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-208ENST00000613073 2778 ntTSL 219.88■□□□□ 0.771e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-208ENST00000511538 1345 ntTSL 219.26■□□□□ 0.671e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.61e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.561e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 COG4-204ENST00000524584 550 ntTSL 418.41■□□□□ 0.541e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.511e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 COG4-209ENST00000562200 885 ntTSL 217.56■□□□□ 0.41e-5■■■■□ 21.3
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G3BP1Q13283 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 516.92■□□□□ 0.31e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-211ENST00000515490 733 ntTSL 416.75■□□□□ 0.271e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-202ENST00000503160 1860 ntTSL 516.43■□□□□ 0.221e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 214.55□□□□□ -0.081e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NUP214-209ENST00000489260 649 ntTSL 314.2□□□□□ -0.141e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-211ENST00000488487 1137 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NUP93-205ENST00000563437 762 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SMNDC1-203ENST00000460483 753 ntTSL 313.66□□□□□ -0.221e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-203ENST00000505211 697 ntTSL 513.52□□□□□ -0.251e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MED1-204ENST00000581334 580 ntTSL 313.29□□□□□ -0.281e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-214ENST00000515884 779 ntTSL 512.29□□□□□ -0.441e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MRPL46-204ENST00000559538 727 ntTSL 311.7□□□□□ -0.541e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-205ENST00000468447 583 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.571e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MKRN1-203ENST00000463142 460 ntTSL 410.76□□□□□ -0.691e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 210.75□□□□□ -0.691e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MRPL46-203ENST00000558660 5561 ntTSL 210.57□□□□□ -0.721e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 GATB-212ENST00000515564 6552 ntTSL 210.27□□□□□ -0.761e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.851e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.041e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PDLIM1-203ENST00000490391 458 ntTSL 28.55□□□□□ -1.041e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 COG4-208ENST00000534772 647 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.321e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.361e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.491e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.531e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 CRYZ-207ENST00000492102 2899 ntTSL 1 (best)4.34□□□□□ -1.711e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.741e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.821e-5■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-9■■■■□ 21.3
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