Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3BQ13214 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3BQ13214 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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