Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANK3Q12955 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANK3Q12955 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ANK3Q12955 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANK3Q12955 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANK3Q12955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANK3Q12955 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANK3Q12955 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms