Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF2Q12933 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF2Q12933 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF2Q12933 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms