Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN2Q12907 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN2Q12907 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
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