Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN1Q12860 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN1Q12860 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN1Q12860 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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