Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPQ12770 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPQ12770 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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