Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAGPQ0VAQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms