Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC15Q0P6D6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC15Q0P6D6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC15Q0P6D6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms