Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF543Q08ER8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF543Q08ER8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms