Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC1Q08554 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSC1Q08554 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms