Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4DQ08499 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DQ08499 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DQ08499 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DQ08499 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DQ08499 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4DQ08499 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4DQ08499 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4DQ08499 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4DQ08499 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4DQ08499 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4DQ08499 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4DQ08499 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4DQ08499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE4DQ08499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4DQ08499 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PDE4DQ08499 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDE4DQ08499 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms