Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRYQ05066 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRYQ05066 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRYQ05066 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRYQ05066 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRYQ05066 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRYQ05066 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRYQ05066 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRYQ05066 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRYQ05066 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRYQ05066 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRYQ05066 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRYQ05066 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRYQ05066 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRYQ05066 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRYQ05066 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRYQ05066 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRYQ05066 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRYQ05066 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRYQ05066 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRYQ05066 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRYQ05066 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRYQ05066 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRYQ05066 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRYQ05066 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRYQ05066 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRYQ05066 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRYQ05066 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRYQ05066 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRYQ05066 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRYQ05066 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRYQ05066 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms