Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP7AQ04656 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATP7AQ04656 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATP7AQ04656 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms