Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAP1Q03518 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAP1Q03518 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms