Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFITM3Q01628 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFITM3Q01628 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms