Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CRB1P82279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CRB1P82279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CRB1P82279 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CRB1P82279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CRB1P82279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CRB1P82279 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CRB1P82279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CRB1P82279 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CRB1P82279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CRB1P82279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CRB1P82279 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRB1P82279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRB1P82279 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRB1P82279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRB1P82279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRB1P82279 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRB1P82279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRB1P82279 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CRB1P82279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CRB1P82279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CRB1P82279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CRB1P82279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRB1P82279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRB1P82279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRB1P82279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRB1P82279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRB1P82279 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRB1P82279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRB1P82279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRB1P82279 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CRB1P82279 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRB1P82279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRB1P82279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRB1P82279 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRB1P82279 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRB1P82279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRB1P82279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRB1P82279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRB1P82279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRB1P82279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRB1P82279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CRB1P82279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CRB1P82279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRB1P82279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRB1P82279 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRB1P82279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRB1P82279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRB1P82279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CRB1P82279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRB1P82279 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CRB1P82279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRB1P82279 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRB1P82279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRB1P82279 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CRB1P82279 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CRB1P82279 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRB1P82279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CRB1P82279 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRB1P82279 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRB1P82279 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRB1P82279 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRB1P82279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRB1P82279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRB1P82279 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms