Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM258P61165 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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