Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP11P59045 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP11P59045 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NLRP11P59045 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP11P59045 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms