Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJA9P57773 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJA9P57773 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJA9P57773 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJA9P57773 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJA9P57773 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJA9P57773 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJA9P57773 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJA9P57773 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJA9P57773 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJA9P57773 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJA9P57773 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJA9P57773 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJA9P57773 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJA9P57773 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA9P57773 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA9P57773 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA9P57773 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA9P57773 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJA9P57773 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA9P57773 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA9P57773 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA9P57773 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA9P57773 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA9P57773 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA9P57773 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA9P57773 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA9P57773 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA9P57773 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJA9P57773 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA9P57773 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA9P57773 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA9P57773 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA9P57773 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA9P57773 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA9P57773 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA9P57773 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA9P57773 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms