Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF3P57682 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF3P57682 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF3P57682 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF3P57682 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF3P57682 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF3P57682 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF3P57682 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF3P57682 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF3P57682 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF3P57682 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF3P57682 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF3P57682 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF3P57682 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF3P57682 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF3P57682 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF3P57682 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF3P57682 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF3P57682 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF3P57682 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF3P57682 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF3P57682 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF3P57682 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF3P57682 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF3P57682 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF3P57682 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF3P57682 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF3P57682 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF3P57682 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF3P57682 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms