Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP1P56182 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP1P56182 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRP1P56182 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1P56182 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1P56182 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1P56182 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRP1P56182 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP1P56182 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP1P56182 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRP1P56182 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1P56182 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1P56182 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1P56182 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRP1P56182 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP1P56182 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRP1P56182 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1P56182 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1P56182 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRP1P56182 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRP1P56182 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1P56182 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1P56182 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP1P56182 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1P56182 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1P56182 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP1P56182 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP1P56182 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP1P56182 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP1P56182 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1P56182 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1P56182 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP1P56182 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP1P56182 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RRP1P56182 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP1P56182 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP1P56182 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP1P56182 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP1P56182 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP1P56182 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP1P56182 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP1P56182 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP1P56182 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP1P56182 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RRP1P56182 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP1P56182 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms