Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFV3P56181 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFV3P56181 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFV3P56181 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms