Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX9P55771 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX9P55771 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX9P55771 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX9P55771 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX9P55771 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX9P55771 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX9P55771 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX9P55771 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX9P55771 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX9P55771 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX9P55771 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX9P55771 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX9P55771 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX9P55771 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX9P55771 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX9P55771 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX9P55771 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms