Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPD52P55327 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPD52P55327 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPD52P55327 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPD52P55327 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPD52P55327 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52P55327 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52P55327 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52P55327 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52P55327 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPD52P55327 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPD52P55327 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPD52P55327 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPD52P55327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52P55327 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52P55327 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52P55327 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52P55327 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52P55327 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52P55327 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52P55327 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52P55327 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52P55327 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52P55327 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52P55327 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52P55327 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52P55327 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms