Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD23BP54727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD23BP54727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms