Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFIP1P53367 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms