Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST1P52848 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST1P52848 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST1P52848 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST1P52848 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST1P52848 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST1P52848 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST1P52848 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST1P52848 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST1P52848 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST1P52848 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDST1P52848 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDST1P52848 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDST1P52848 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NDST1P52848 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST1P52848 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST1P52848 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST1P52848 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST1P52848 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDST1P52848 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDST1P52848 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDST1P52848 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDST1P52848 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDST1P52848 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDST1P52848 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDST1P52848 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDST1P52848 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDST1P52848 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDST1P52848 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDST1P52848 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDST1P52848 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDST1P52848 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDST1P52848 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDST1P52848 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDST1P52848 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDST1P52848 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDST1P52848 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDST1P52848 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDST1P52848 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NDST1P52848 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDST1P52848 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDST1P52848 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDST1P52848 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDST1P52848 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NDST1P52848 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDST1P52848 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms