Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEK2P51955 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK2P51955 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK2P51955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK2P51955 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK2P51955 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK2P51955 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK2P51955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK2P51955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK2P51955 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK2P51955 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK2P51955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK2P51955 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK2P51955 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK2P51955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK2P51955 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK2P51955 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK2P51955 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK2P51955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK2P51955 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK2P51955 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK2P51955 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK2P51955 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK2P51955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK2P51955 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK2P51955 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK2P51955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK2P51955 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK2P51955 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK2P51955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK2P51955 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK2P51955 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK2P51955 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK2P51955 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK2P51955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK2P51955 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK2P51955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK2P51955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK2P51955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK2P51955 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEK2P51955 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEK2P51955 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEK2P51955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK2P51955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK2P51955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK2P51955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEK2P51955 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK2P51955 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK2P51955 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms