Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN3P51790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLCN3P51790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms