Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR4P51571 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR4P51571 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR4P51571 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR4P51571 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR4P51571 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR4P51571 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR4P51571 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR4P51571 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR4P51571 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR4P51571 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR4P51571 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR4P51571 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR4P51571 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR4P51571 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR4P51571 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR4P51571 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR4P51571 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR4P51571 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR4P51571 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR4P51571 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR4P51571 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR4P51571 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR4P51571 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR4P51571 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR4P51571 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR4P51571 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR4P51571 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR4P51571 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR4P51571 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR4P51571 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR4P51571 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR4P51571 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR4P51571 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms