Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8P50990 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8P50990 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8P50990 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8P50990 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8P50990 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8P50990 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8P50990 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8P50990 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8P50990 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8P50990 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8P50990 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8P50990 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8P50990 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8P50990 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCT8P50990 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT8P50990 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT8P50990 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8P50990 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8P50990 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8P50990 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT8P50990 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8P50990 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT8P50990 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms