Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPOXP50336 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPOXP50336 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PPOXP50336 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPOXP50336 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPOXP50336 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPOXP50336 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPOXP50336 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPOXP50336 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPOXP50336 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPOXP50336 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPOXP50336 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPOXP50336 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPOXP50336 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPOXP50336 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPOXP50336 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPOXP50336 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPOXP50336 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPOXP50336 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPOXP50336 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPOXP50336 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPOXP50336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPOXP50336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPOXP50336 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPOXP50336 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPOXP50336 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPOXP50336 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPOXP50336 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPOXP50336 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPOXP50336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPOXP50336 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPOXP50336 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms