Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUP153P49790 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUP153P49790 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NUP153P49790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUP153P49790 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUP153P49790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NUP153P49790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NUP153P49790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NUP153P49790 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NUP153P49790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NUP153P49790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NUP153P49790 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NUP153P49790 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NUP153P49790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP153P49790 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP153P49790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP153P49790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP153P49790 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NUP153P49790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NUP153P49790 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUP153P49790 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUP153P49790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUP153P49790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
NUP153P49790 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NUP153P49790 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP153P49790 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP153P49790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP153P49790 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP153P49790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NUP153P49790 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NUP153P49790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NUP153P49790 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NUP153P49790 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NUP153P49790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NUP153P49790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NUP153P49790 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP153P49790 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP153P49790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP153P49790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP153P49790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NUP153P49790 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP153P49790 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NUP153P49790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NUP153P49790 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NUP153P49790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP153P49790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP153P49790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP153P49790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP153P49790 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP153P49790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP153P49790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP153P49790 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP153P49790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP153P49790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUP153P49790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NUP153P49790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUP153P49790 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP153P49790 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP153P49790 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP153P49790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP153P49790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP153P49790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP153P49790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NUP153P49790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NUP153P49790 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NUP153P49790 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NUP153P49790 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP153P49790 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP153P49790 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP153P49790 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP153P49790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP153P49790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms