Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLMP48507 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLMP48507 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLMP48507 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLMP48507 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLMP48507 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLMP48507 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLMP48507 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLMP48507 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLMP48507 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLMP48507 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLMP48507 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLMP48507 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLMP48507 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLMP48507 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLMP48507 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLMP48507 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLMP48507 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLMP48507 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLMP48507 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLMP48507 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLMP48507 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLMP48507 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLMP48507 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLMP48507 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLMP48507 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLMP48507 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLMP48507 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLMP48507 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLMP48507 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLMP48507 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLMP48507 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCLMP48507 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCLMP48507 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCLMP48507 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCLMP48507 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCLMP48507 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCLMP48507 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCLMP48507 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCLMP48507 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCLMP48507 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCLMP48507 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCLMP48507 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCLMP48507 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCLMP48507 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCLMP48507 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCLMP48507 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCLMP48507 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCLMP48507 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCLMP48507 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GCLMP48507 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCLMP48507 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCLMP48507 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCLMP48507 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCLMP48507 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GCLMP48507 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCLMP48507 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCLMP48507 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms