Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PREPP48147 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREPP48147 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREPP48147 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREPP48147 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREPP48147 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PREPP48147 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PREPP48147 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PREPP48147 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREPP48147 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREPP48147 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PREPP48147 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PREPP48147 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PREPP48147 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PREPP48147 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREPP48147 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PREPP48147 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREPP48147 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREPP48147 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PREPP48147 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREPP48147 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PREPP48147 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREPP48147 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PREPP48147 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PREPP48147 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PREPP48147 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PREPP48147 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PREPP48147 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PREPP48147 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREPP48147 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREPP48147 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREPP48147 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PREPP48147 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PREPP48147 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREPP48147 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREPP48147 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREPP48147 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PREPP48147 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREPP48147 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREPP48147 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PREPP48147 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREPP48147 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PREPP48147 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PREPP48147 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PREPP48147 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms