Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA4P48058 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIA4P48058 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms