Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRCC3P46736 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCC3P46736 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCC3P46736 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms