Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCR1P46094 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCR1P46094 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCR1P46094 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCR1P46094 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCR1P46094 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XCR1P46094 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XCR1P46094 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XCR1P46094 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XCR1P46094 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XCR1P46094 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XCR1P46094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XCR1P46094 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XCR1P46094 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XCR1P46094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XCR1P46094 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XCR1P46094 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XCR1P46094 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XCR1P46094 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XCR1P46094 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XCR1P46094 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XCR1P46094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XCR1P46094 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XCR1P46094 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XCR1P46094 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XCR1P46094 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XCR1P46094 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XCR1P46094 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XCR1P46094 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XCR1P46094 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XCR1P46094 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms