Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSKP43235 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSKP43235 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSKP43235 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSKP43235 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSKP43235 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSKP43235 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSKP43235 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSKP43235 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSKP43235 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSKP43235 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSKP43235 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSKP43235 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSKP43235 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSKP43235 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSKP43235 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSKP43235 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSKP43235 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSKP43235 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSKP43235 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSKP43235 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSKP43235 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSKP43235 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSKP43235 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSKP43235 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSKP43235 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSKP43235 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSKP43235 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSKP43235 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTSKP43235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSKP43235 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSKP43235 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSKP43235 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSKP43235 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSKP43235 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSKP43235 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms