Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER3P43115 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGER3P43115 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGER3P43115 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGER3P43115 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms