Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP3P42574 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP3P42574 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP3P42574 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP3P42574 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP3P42574 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP3P42574 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP3P42574 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP3P42574 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP3P42574 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP3P42574 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP3P42574 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP3P42574 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP3P42574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP3P42574 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP3P42574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP3P42574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP3P42574 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP3P42574 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP3P42574 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP3P42574 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP3P42574 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP3P42574 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP3P42574 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP3P42574 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP3P42574 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP3P42574 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms