Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPHP41219 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPHP41219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPHP41219 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPHP41219 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPHP41219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPHP41219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPHP41219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPHP41219 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPHP41219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPHP41219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPHP41219 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPHP41219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPHP41219 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPHP41219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPHP41219 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPHP41219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPHP41219 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPHP41219 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPHP41219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPHP41219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPHP41219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPHP41219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPHP41219 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPHP41219 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPHP41219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPHP41219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPHP41219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPHP41219 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPHP41219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPHP41219 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPHP41219 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRPHP41219 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPHP41219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPHP41219 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPHP41219 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms