Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACVR1BP36896 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACVR1BP36896 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms